针对某个细菌研究其耐药性,想通过全基因组数据和药敏表型数据做关联分析,找到造成耐

针对某个细菌研究其耐药性,想通过全基因组数据和药敏表型数据做关联分析,找到造成耐药表型产生的重要基因或遗传因子。其中,自变量是基因或变异特征的有无,耐药表型是耐药、敏感、中介这3个取值。因为考虑到耐药表型与不同基因表达有关,且不通基因表达造成的耐药程度水平也不一样,所以想构建模型对于某一药物耐药表型预测,找到其相关的重要基因及权重系数,最终可以基于这些基因对其他菌株进行耐药表型预测。请问,选择哪种方法建模比较好呢,其中有哪些需要注意的地方呢