紧急求助!!!!!!!!

老师您好,我想请教一下,如果拟探究合并A疾病与不合并A疾病的两组患者使用某种药物前及使用后1年时的某连续变量指标的变化是否相同,如果发现两组指标的基线水平有差异,请问还能继续分析吗?如果能分析,如果不满足正态分布,可以用两独立样本非参数检验去比较差值是否异同吗?谢谢。