文献是科研的起点，如何检索？检索后怎么整理呢？
这是一个带你入门科研的教程。从基本的文献检索、管理、阅读和整理入手，这篇笔记也分享了每一步可以大大提高效率的科研神器，希望能帮到你。
#01 文献检索
文献检索就好比捕鱼，你要捕什么样类型的鱼就要去特定的海域去捕，不能广泛撒网。在一般的领域理解或者文献综述时，我们往往需要大量的文献阅读，这样对于文献与你感兴趣的主题关联度高就显得特别重要。首先建议用比较权威的PubMed和Web of Science这种文献检索引擎精确查找与你的领域最相关的目标文献。当找到一篇目标文献，接下来的工作可以完全交给文献映射工具如：Research Rabbit，Litmaps，Connected Papers等等。它们可以根据你的现有的这篇论文，在几秒钟内为你找到所有关联度高的相似论文，为你节省巨量的时间。最后用sci-hub下载文献，输入文献doi号即可查找。
PubMed：精准高效的文献检索
▲官网：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
PubMed是美国国家医学图书馆下属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的因特网生物医学信息检索系统。它整合在NCBI的统一检索平台Enterz上，与该平台其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索。可以说PubMed是科研人员必不可少的文献数据库。PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能,侧边工具栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务，免费提供题录和文摘，可与提供原文的网址链接，提供检索词自动转换匹配，操作简便、快捷。
Connected Papers：写论文综述的神仙网站
▲官网：https://www.connectedpapers.com/
Connected Papers是一个可以构建知识图谱的网站。进入官网，输入你找到的该领域比较重要的文献题目或DOI号，选中文献即可形成图谱。图谱主要反映文献的引用和被引关系。点击上方Prior Works呈现的是最常被引用的论文，通常是这个课题的敲门砖，可以大致浏览，快速了解领域；点击上方的Derivative Works是关于这个课题的综述和相关工作的列举，帮助了解新进展。也可以进行中文文献的构建，但是需要选择引用量高，被引较多的文献，否则不易生成知识图谱。唯一的问题是，需要对你选择的文献有把握，输入的文献得是你认为这个领域的重点文献，一般来说时间为近2-3年，引用度较高的文献，否则容易走偏，把握不准核心。
#02 文献管理
文献内容多，数量多的时候经常读后就忘，好记性不如烂笔头，只好在整理上多下功夫了。如果你还在手动格式化你的参考文献,你也绝对需要开始使用一个自动的文献管理软件，它可以毫不夸张的给你节约几天甚至几周的时间。我个人使用的文献管理器是Zotero，另外我了解到比较好用的还有Mendeley、Endnote等等。管理器不是重点，只要自己建立一套简便的管理体系就可以，所以大家随意选择一个自己喜欢的，熟练的掌握它就行。除此之外，针对一些重要文献，我会另外做一个PPT总结，截图论文标题和作者，以及关键的scheme图，另外加一点自己的总结描述和读后感，方便以后串联起来。
Zotero：开源免费的文献管理软件
▲官网：https://www.zotero.org/
Zotero是一个开放源代码的文献管理软件。Zotero特色之处是可以作为浏览器插件进行使用。本地的Zotero的文献数据库还可以免费上传到Zotero的网络服务器上，并且不受空间大小限制。但是本地的Zotero的附件，在网络服务器上有大小限制，Zotero的网络服务器仅为每个用户提供300M免费存储容量。Zotero相比于EndNote，免费不用说，最大的特色是无限级的目录分类，一个目录下可以分为多个子目录。这样管理起来文献就方便多了，而EndNote只支持二级目录。Zotero还支持文献的标签功能。为每个文献自动打上标签,当然用户也可以自定义标签，这又增加了文献管理功能。不过Zotero的插入引文和参考文献相比于EndNote来就弱了许多，支持的输出格式也相对有效，只是支持几个大类的输出格式，并没有具体的杂志格式。
#03 文献阅读
这是核心的部分—你必须真正阅读这些论文。之前的01和02也是为了高效省时的阅读论文做的准备和铺垫。有用的文献通过你的文献管理工具被你存储在一起，接着使用好用的文献阅读器，做出你的标记和笔记，这样可以让你的科研效率大大提高。论文阅读要有一个模式化的工作流程，在文献综述或者论文检索中，我不建议出现精读，反之，应该是用到如下的阅读方法:
1. 浏览摘要：只阅读摘要部分。这一步相当于你的初步筛选，摘要一般包括这篇文章的研究背景、目的、方法以及主要结论。如果他们真正是你的需求范围内，那么这篇文章才会被你继续阅读。
2. 阅读图表：如果该文献pass了第一步，那么它的图片和表格应该是你最需要关注的部分，他们提供了这个文章最主要的结论和成果。
3. 阅读结论：文献的结论往往更加具体的给出了针对这一研究问题得出的最后结论，通过阅读它可以让你最终确定该文献是不是你所需要的。
这里，我安利一个快速阅读文献的网站—SciSpace。
SciSpace：让AI帮你解读论文
▲官网：https://typeset.io/
SciSpace是一款基于人工智能的科学研究工具，可以帮助你快速搜索和分析科学文献。它的重点功能有支持中文解读和对话式的论文解读。文件导入有两种方式：1）直接导入PDF文档；2）账号同步Zotero，直接导入Zotero分类文件。上传后就可以让AI帮你解读论文，抓取文章的主要研究背景、研究目的、研究方法、创新点、结论、配图等信息。操作简单，想了解哪一部分直接划选，对话框内就会自动总结选段内容，属实是科技狠活。不过小编在这里提醒，时间允许的情况下，还是自己好好阅读原文吧，毕竟人工智替代不了人。
#04 文献管理
一旦你按照上述方式养成了良好的阅读习惯，确保你的笔记有条不紊和便于查阅，便是你的文献检索最终输出成你的论文或者综述的必要方式。这里我要强烈安利Notion，超级适合用于归纳资料。当然，Notion的学习曲线本身就很高，如果不熟悉的同学也有更简单的选择。一个简单的电子表格通常就能完成这项工作。创建一个表格，详细记录你读过的所有论文。这应该包括论文的状态（例如，你是否读过它)以及它可能与哪些项目有关。
Notion：打造自己的文献资料库
▲官网：https://www.notion.so/zh-cn
Notion是一种自由形式的数据库，用于组织各种信息，包括笔记、项目和任务。它的基础使用逻辑其实很简单，即一种搭积木式的建立架构：将不同的模块组合到一起，打造属于自己的应用系统。也就是说，使用Notion，就是一个梳理自己思维模式的过程。首先，先整理清楚你的定位—你想用Notion来帮助整理你的哪些方面？比如作为在读博士生，我主要使用Notion来管理我的文献阅读进度，提醒我的一些待办事项和任务。具体的使用方法可以参考网上教学视频，灵活使用快捷键“/”和基础板块“table”。
转载自公众号：Needle科研星球