基因组关联研究（GWAS）是通过在整个基因组范围内检测单核苷酸多态性（SNP）与特定表型之间的关联，来发现影响该表型的基因位点。在进行GWAS分析时，首先需要获取GWAS汇总统计数据。这里分享几个常用的GWAS统计数据的下载网址：

PGC：

Psychiatric Genomics Consortium (PGC)网站提供了抑郁症,双相情感障碍,精神分裂症等精神疾病的GWAS summary data。该组织由多个机构合作完成了多个大样本量的GWAS meta分析。数据下载需注册账号。

网站:https://www.med.unc.edu/pgc/

SSGAC:

Social Science Genetic Association Consortium (SSGAC)提供了教育水平,经济和政治取向,人格等行为遗传学相关表型的GWAS数据。数据下载无需注册。

网站:https://www.thessgac.org/

CTG:

The Netherlands’s CTG lab 提供了100多个常见疾病和人体表型的GWAS汇总统计数据,包括代谢、心血管、免疫、癌症等的GWAS数据。数据下载需在邮件中申请。

网站:https://ctg.cncr.nl/software/summary_statistics

FinnGen:

芬兰FinnGen项目汇总了多种疾病的GWAS和PheWAS结果,包含了10多万芬兰参与者的基因组和电子健康记录数据。下载需在项目网站注册。

网站:https://www.finngen.fi/en

GWAS Catalog:

欧洲生物信息研究所(EBI)汇总的GWAS Catalog收录了已发表的各种疾病和表型的GWAS结果。数据可以直接下载。

网站:https://www.ebi.ac.uk/gwas/

UK biobank:

UK biobank项目网站上提供了其238万参与者GWAS分析的summary statistics结果。目前已经完成了2000多个表型的GWAS。数据下载需注册。

网站:http://www.nealelab.is/uk-biobank

GWAS ATLAS:

荷兰CTG实验室开发的GWAS ATLAS工具,可以用于GWAS数据的交互查询、下载和meta分析。

网站:https://atlas.ctglab.nl/

转自：微信公众号 生信私学 作者 文云博士