推荐一款all in 的文献管理软件【边写边搜】

最近了解到一个多功能的文献管理工具——【边写边搜】,这个名字乍一看像是写作的辅助工具,实际上这个软件的强大功能远不止于此……

作为曾经的科研工作者,我的日常工作需要围绕读文献和写论文展开,从idea的构建—研究设计—实验开展—数据收集—论文的写作与修改,这整个过程涉及到读与写的工作量就占了一半以上。相关的文献数量也通常比较大,最大的困境就是如何使将二者协同管理并产生联动。

具体来说,在一个研究开始的早期,我通常会先检索研究领域相关的文献,下载并通读重要文献。然后集中整理这篇文章相关的笔记,就这样从一篇文章到几十篇类似主题的文章。形成idea后做研究设计,这一步通常也离不开文献,要从已有的文献中找到验证假设的研究方法、技术手段和细节,还要一步步悉心验证,避免引入人为误差。数据采集、整理后就要进行文章撰稿,这时候就不可避免地要用到理论构建和研究设计时参考的文献,还要琢磨论证的技巧与方法。

这样一来,除了做实验、分析数据这些流水线式的工作,完成这样一个科研工作流至少需要四个软件/工具(文献检索与下载-文献阅读-文献笔记-写作[以及写作中最令人头疼的参考文献的插入])。还要时常在不同的软件、网站和插件间来回切换。这实在是太麻烦了!

1、那些年管理文献用过的软件/工具

最早用到的两款主流的文献管理工具是NoteExpressEndNote,是我在研一小白阶段学习和使用的。当然,美其名曰是文献管理,实际上我只用这两款软件来插参考文献(实在是太难上手了,且没有重要的笔记功能,都不知道这俩咋好意思叫文献管理?)。NE因为种种原因没用下去,EN则成为我最主要的参考文献管理工具,一直沿用至今。

文献阅读当时随大流用的是知云文献翻译,后来换成了WPS,主要是当时没有大模型的阅读相对简单,我日常是只需要翻译和笔记这两个功能,所以WPS的云端其实是更有助于我在多个设备间来回切换。

文献检索和下载感觉我很早(大概在研一,2020年)就接触到了同类里天花板级别的工具(纯主观)——PubMedPro,当年它还是一个仅仅打着[可以显示影响因子的文献检索网站]为旗号的文献检索网站,每天凌晨四点同步Pubmed数据库,以弥补pubmed对非母语科研工作者不友好的缺陷。现在虽然还是这句低调的、好像只专注做了一件事的slogan,可pro已经从当初的文献检索,发展为一个集文献检索—文献下载—文献阅读—文献笔记—文献管理(主要是免费的云端同步)—论文写作(主要是语料库)为一体的文献管理工具,甚至比声名在外的Zotero还要丝滑(依然还是纯主观)。Zotero最大的问题就是没有翻译功能,这实在是劝退我!

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图. 附一个文献管理界面

不过,pro对一些较新的文献没有下载权限,只能下载好了上传到云端。

2、【边写边搜】如何将这些功能all in one?

第一步:安装【边写边搜】的浏览器插件,在检索界面直接导入题录,或者输入DOI号也可以:

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有PDF的也可以直接导入PDF,不用下载到本地再上传:

https://dr2pp.oss.ns-svc.cn/oC/oCoW/oCoWUPRgJ9Ix0Fw1EcLU.png

第二步:进行文献的分类和管理。界面如下:

https://dr2pp.oss.ns-svc.cn/MM/MMmu/MMmurL6ykrw384Uvw5Pr.png

可以对每个分类下的文献打上不同的标签,侧边工具栏也可以显示文献的题录信息(可修改)、图例、参考文献等内容,这里的参考文献不仅进行了系统的分类,而且也可以一键添加题录,再也不用到EndNote一个个搜索导入了。

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第三步,文献笔记。

中间是文献主体。最左侧显示文献的工具区,到这里都和Zotero等无甚差比,只是基本的文献标注,能够满足大部分人的备注需求。

右侧是工具区,包含【摘录笔记、笔记导图、基本信息、附件关联、划词翻译、划线查词、对比阅读、AI助手】等几大功能。

这里最让我眼前一亮的工具有三个:摘录笔记、笔记导图和附件关联

  • 摘录笔记有助于构建自己的语料库,虽然之前有看到有同学用Zotero自建语料库,但对我而言有点难度,不如这种一键摘录更容易上手。
  • 笔记导图相当于把XMind、MindMaster等思维导图工具嵌入到这里,作为一个在文献管理软件中的导图工具,功能已经非常完备了。思维导图无非就是整合文章的基本结构,构建结构化思维,有利于在一篇文献下串联起每一个知识点。如果说摘录笔记记录的是零碎的知识点,那么笔记导图就是将这些零碎知识点连接起来的线
  • 附件关联。这个功能绝对是该软件中最核心的亮点。但如何用好这个功能,则对使用者提出了比较高的要求。为什么这么说呢?是因为如果说笔记导图串起了一篇文献的知识脉络,那么文献关联(可以是文件、也可以是网页)则是串起了一个主题相关的所有研究的知识脉络。无论是撰写综述,还是提出新的研究假设,都需要在特定领域内构建这样宏大的框架,才有可能提出新的东西。这对每个研究者来说,不可谓要求不高。

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第四步,生成参考文献。

这里需要安装Word插件。在生成引文时,先点击Incite-立即体验

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然后选择投稿期刊的引文格式(这里以Nature为例;当然也可以自定义)—更新导入目录—定稿。这样一个完整的参考文献生成的全流程就结束啦!

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除了上述四个基本的功能,边写边搜索还有许多其他功能,比如内置的文档(界面真的很好看)、学术导航区……

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更多的功能,各位小伙伴也可以自行试用体会~

附链接: https://app.fir.ai/sign-in