
3月1日,生物医学文献数据库PubMed的短暂宕机,引发了很多研究者的恐慌。尽管此次中断并非有意为之,而且服务已经恢复,但这一事件凸显了科研人对该网站的依赖,并引发了许多人对PubMed未来的担忧。
PubMed数据库索引了超过3700万篇文章,由美国国立卫生研究院(NIH)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)维护。NIH在给《Nature》的电子邮件中表示,3月1日“NIH的部分公共网络服务出现了中断”,但所有服务已于3月2日恢复。
尽管存在其他替代数据库,但PubMed之所以突出,是因为它是一个免费访问、全面的数据库,汇集了大量的生物医学文献。
宕机事件
3月1日,一些研究人员注意到PubMed网站没办法使用。“Omg,PubMed宕机了吗???”这是加州洛杉矶UCLA Health的医生和呼吸科研究者Thanh Neville在社交媒体平台Bluesky上发的帖。
一些研究人员担心该网站已被美国总统特朗普政府关闭。因为过去几周,多个联邦政府网站的内容因特朗普政府发布的行政命令而被撤回或修改。
但软件开发者、Power DNS公司联合创始人Bert Hubert表示,某些地区的用户仍然可以访问该网站,因此他得出结论,该网站并非被故意关闭。“如果是故意的,那么所有人都将无法访问,”他说,就像美国国际开发署网站的情况一样。
Hubert表示,目前尚不清楚是什么原因导致了这一问题。“应该对此进行非常严肃的调查,了解为什么会发生这种情况,以及为什么需要两天时间才能恢复,因为这是全球关键的基础设施。”
替代数据库
澳大利亚维多利亚州研究循证医学的独立科学家Hilda Bastian担心,如果NCBI中具备维护PubMed所需专业知识和机构知识的工作人员因美国联邦政府机构的大规模裁员而失业,PubMed的中断可能会变得更加频繁。Bastian曾在2011年至2018年间在NCBI工作。
如果PubMed出现问题,一个值得注意的替代方案是Europe PMC,该数据库由英国欣克斯顿的欧洲分子生物学实验室欧洲生物信息学研究所运营,拥有PubMed数据库的副本,包括其全文存档PubMed Central以及其他预印本档案。Bastian表示,只要PubMed正常运行,即使网站宕机,其存档内容也可以通过欧洲PMC访问。但她指出,欧洲PMC并不是PubMed的直接镜像。
此外,还有一些私有的学术数据库,例如谷歌拥有的Google Scholar,它提供免费的学术文献全文搜索;以及面向付费用户的引文数据库,如科睿唯安的Web of Science和Elsevier的Scopus。OpenAlex则提供了这些文献计量数据库的开放获取替代方案。
意大利的遗传学家Piero Carninci希望其他国家能够创建更多的学术信息替代库,以便科学家不依赖于单一的索引或网站。“如果这不仅仅是一次偶然事件,我们将陷入严重困境,这可能会延迟全球的研究进展,”。
文章来源: https://www.nature.com/articles/d41586-025-00674-3